宋慈（何冰饰）参加京试，考中进士。 回国结婚后，他将与好友孟良辰（吴军饰）一起前往边陲小镇。 没想到，宋慈的父亲宋恭一直到结婚那天才回家。 当两位新婚夫妇正在祭拜时，一辆马车运回了父亲的尸体。 宋恭一生从事监狱审讯，从未犯过任何错误。 然而，他因误判而功亏一篑。 这是对他的死的道歉，他还留下了遗书。 宋氏后裔被禁止进入监狱。 不料祸不单行，孟良辰上任途中被杀的噩耗传来。 在母亲的劝说下，宋慈走遍全城，为好友查清案情，将其绳之以法。 宋慈因此晋升为大理寺六品，后又被任命到外省监狱任职。 宋慈先后查破了“安定县冤案”、“李府连环案”、“毛竹坞无头案”、“城南靖尸案”、“残扇案”、“梁羽命案”、 “李玉谷失踪案”等悬案接二连三……