唐高宗年间，严立本遇到被冤狱的狄仁杰（任嘉伦饰）。皇上派他去感业寺查案，决定带狄仁杰一起去。在感业寺，狄仁杰解决了一个奇案，化解了一场佛教劫难，结识了武媚娘。狄仁杰一鸣惊人，被皇上派到并州。在此期间，他屡屡破案，被称为神判。不时有前朝鬼兵杀人。狄仁杰去查了查，发现与前朝的宝物和蒲王李泰的背叛意图有关，但证据已毁，无法联系。这时，武媚娘杀了自己的女儿，责怪国王和王后。皇帝叫狄仁杰回长安察看。根据武媚娘提供的线索，狄仁杰破案，在李泰府中找到了前朝的宝物，成为普王造反的真实证据。而狄仁杰也知道，在之前的破案过程中遇到瓶颈时，是吴媚娘解开了他的疑惑。不久后，唐高宗因暴风，令武媚娘一同上朝，合称第二圣朝。