在古巴关塔那摩湾的美国海军基地，两名海军陆战队员道森和多尼被指控杀害了另一名士兵圣地亚哥。 海军律师丹尼尔·卡菲（汤姆·克鲁斯饰）和他的助手山姆被派去接手此案。 他们调查圣地亚哥曾希望调离基地并举报了道森。 卡菲曾想进行庭外谈判并寻求两年徒刑。 然而，两名士兵坚称自己无罪。 他们对圣地亚哥的行为，就是执行上级给他们下达的“红色规定”。 所谓红规，是在军官默许下，由士兵私下进行的一种纪律规定。 卡菲、萨姆和另一名女律师加洛韦（黛米·摩尔 饰）组成辩护律师展开调查，而基地指挥官杰瑟普上校（杰克·尼科尔森 饰）是案件的关键人物，他拒绝了圣地亚哥的调动申请，向圣地亚哥发出了“红色规则” 他，后来未经允许篡改了飞行记录。 卡菲虽然知道真相，但苦于证据不足。 在这种情况下，如果他作证指控杰赛普上校，就会给自己带来麻烦。 这场关乎正义的官司将会有怎样的结果呢？